Gromacs 並列化の例
Gromacs は、主に生化学分子の分子動力学をシミュレートするために使用されるパッケージです。 また、ポリマーなどの非生物学的システムにおける非結合相互作用の計算にも非常に優れています。
これは、Gromacs on Rescale の並列化機能を示す例です。
シミュレーションは実験であり、シナリオをテストし、作成することです... その他 Code | Gromacs 2018 (単精度) |
Analysis Type | 分子動力学 |
説明 | MPI を使用した Gromacs の例 |
Suggested Hardware | Emerald / 4 cores |
Command |
cd d.dppc; gmx_mpi grompp -v; mpirun -np $RESCALE_CORES_PER_SLOT gmx_mpi mdrun |
Estimated Run Time | 7 minutes |
Previous versions | Import Job Setup v2016 |