ケーススタディ – AZothBio が Rescale でディープラーニングを使用して新薬発見を加速

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スタートアップから世界クラスのバイオ医薬品企業へ

AZothBio の研究者、科学者、エンジニアのチームは、ライフサイエンス、バイオテクノロジー、医薬品などの分野での豊富な経験を有しています。彼らの使命は、各々が有する専門知識を組み合わせて新薬の発見を促進し、競争力のある製品を多くの患者に届けることです。AZothBio は、研究開発を行う際に、デジタルツールと独自の人工知能ロジックを用いて、新しい治療法や新薬候補を発見しています。これらの手法では、忠実度の高いシミュレーションを行うために、膨大なハイパフォーマンスコンピューティング(HPC)リソースが必要となります。

AZothBio のコンピュートニーズがオンプレミスのハードウェアの能力を超えていたため、複雑なカスタムアプリケーションをシンプルかつ拡張性に優れた方法でサポートでき、同社のコアである最先端の R&D イノベーションに注力できるようにするソリューションが必要となりました。その答えは、最先端のRescaleのイノベーションでした。大規模なアルゴリズムをクラウドでシミュレーションするには、研究開発上の課題だけでなく、クラウドインフラストラクチャ、HPC、その構成などを理解しなければなりません。AZothBio は、デジタル環境を変革するために Rescale プラットフォームを採用し、貴重な時間を節約し生産性を向上しました。 

公衆衛生の緊急ニーズに応えるために研究開発能力を変革

AZothBio は、Rescale のクラウド HPC 環境を使用することで、Tech Against COVID-19 プログラムを通じて初めて Rescale と協力しました。これにより、AZothBio はソフトウェアを簡単にオンボードし、その方法論を使用して COVID-19 研究を実施できるようになりました。 Rescale のエンドツーエンドの HPC-as-a-Service ワークフローを使用して、AZothBio は、最高のパフォーマンスのハードウェアを使用してワークロードを実行するために、AWS (Tech Against COVID-19 イニシアチブのスポンサーでもあります) 上で最適なインフラストラクチャを迅速に特定することができました。独自のソフトウェア ニーズに基づいてプロファイルを作成します。 このプログラムを通じて、AZothBio はコロナウイルス感染を標的とした免疫反応性物質を発見するプロジェクトを開始し、すぐに他のプロジェクトに拡大しました。

バイオ医薬品業界は限られたリソースで競争が激しいため、成功するには高度な集中力と効率性が必要です。 リーンスタートアップながら生物医学分野で急速に成長している AZothBio は、研究開発業務の俊敏性を高めるソリューションを必要としていました。 AZothBio は、Rescale プラットフォームを使用することで、従来の方法では不可能な方法で、独自の深層学習ベースのアルゴリズムを使用した大量のデータ分析と予測シミュレーションを通じてリードの特定を加速しながら、効率的なコストパフォーマンスで薬剤候補を選択するための研究システムを構築することができました。

AZothBio 独自のエピトープ予測 AI モデルは、深層学習プロセスを使用し、抗原/抗体反応に関連する生物学的データを分析して、免疫応答を活性化するペプチド配列を予測します。 AI モデルとゲノム解析を組み合わせることで、免疫治療薬やワクチンの開発の可能性が広がります。 しかし、複数の研究分野をスケールアップするにつれて、オンプレミスのコンピューティング環境ではツールの容量と複雑さをサポートできなくなり、ツールを社内で再構築するには時間とコストが法外にかかります。 Rescale を通じて、チームはプリインストールされたソフトウェアと最適な GPU ハードウェアにアクセスして、エピトープ AI モデルを正常に実行し、ゲノムおよびペプチドの発見研究における他の取り組みを 5 回の分析あたり 24 日から XNUMX 時間以内に迅速化することができました。

プラットフォームを活用して現代のイノベーションを推進

イノベーションに適したプラットフォームがあれば、主要な薬剤および治療法の候補の予測と特定を加速できます。 「Rescale はすぐに導入可能で、使いやすい環境を提供します。 以前は、GPU をセットアップするのは私たちにとって大きな負担でしたが、今では Rescale を利用して重要な分析を推進し、コストと遅延のリスクを軽減できることをうれしく思っています」と AZothBio のマネージング ディレクター、Jerry Maeng は述べています。 彼らは今後も Rescale と提携してリード識別のための新しい AI モデルを導入し、バイオ医薬品イノベーションの世界的リーダーになることを計画しています。