AutoDock Vina 예

AutoDock Vina는 일반적으로 다음과 같은 용도로 사용됩니다. 모델 분자 도킹 및 가상 스크리닝용; 약물 발견 및 기타 분자 분석에 중요한 프로세스입니다. AutoDock Vina는 뛰어난 로컬 검색 루틴을 갖춘 향상된 버전이며 멀티코어/멀티 CPU 컴퓨터 설정을 사용합니다.

간단한 작업 흐름을 통해 Rescale의 ScaleX 플랫폼은 배치 모드에서 AutoDock Vina를 사용하여 복잡한 분자 도킹 시퀀스를 실행하는 데 사용할 수 있습니다.

가져오기 작업 설정
작업 결과 가져오기
시뮬레이션 암호AutoDock Vina 4.2.5.1
분석 유형분자 도킹 및 가상 스크리닝
기술설명Vina 4.2.5.1을 사용한 분자 도킹 작업입니다. 먼저 .pdb 파일을 준비하고 AutoDock 유틸리티를 사용하여 Vina에 필요한 .pdbqt 파일로 변환합니다. 그런 다음 conf.txt 파일을 사용하여 AutoDock Vina를 실행합니다.
권장 하드웨어티타늄 / 4코어
Command 
pythonsh $AUTODOCKUTILS/prepare_receptor4.py -r 단백질.pdb; pythonsh $AUTODOCKUTILS/prepare_ligand4.py -l 리간드.pdb; vina --config conf.txt
예상 실행 시간3 분
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