Gromacs 병렬화 예
Gromacs는 주로 생화학 분자에 대한 분자 역학을 시뮬레이션하는 데 사용되는 패키지입니다. 또한 폴리머와 같은 비생물학적 시스템의 비결합 상호작용을 계산하는 데에도 매우 능숙합니다.
이는 Rescale에서 Gromacs의 병렬화 기능을 보여주는 예입니다.
| 시뮬레이션시뮬레이션은 실험, 테스트 시나리오 및 제작입니다. 더 보기 암호 | Gromacs 2018(단일 정밀도) |
| 분석 유형 | 분자 역학 |
| 기술설명 | MPI를 사용한 Gromacs 예제 |
| 권장 하드웨어 | 에메랄드 / 4심 |
| Command |
CD d.dppc; gmx_mpi grompp -v; mpirun -np $RESCALE_CORES_PER_SLOT gmx_mpi mdrun |
| 예상 실행 시간 | 7 분 |
| 이전 버전 | 가져오기 작업 설정 v2016 |